Este refugio se caracteriza por sus bellas playas, arrecifes de coral, bosques tropicales cargados de vida silvestre. Su extraordinaria biodiversidad consta de varios ecosistemas de gran importancia. El refugio esta compuesto de bosques densos con especies como el yolillo, palma cocotera, sajo, cativo, uva de mar y heliconias: un tipo de plantas  que crecen hasta dos metros de altura y tienen unas bellas y sobresalientes brácteas de colores brillantes como rojo y amarillo. Su estuario esta conformado en su mayoría de manglar rojo. El refugio protege especies de animales en peligro de extinción, como el manatí, cocodrilo, danta, caimán, y tepezcuintle. Los monos y los perezosos también son frecuentes. También se pueden observar algunas especies de pájaros como el tucán, águila crestuda real, lapa roja, pericos, pájaro carpintero, arasai, bailarín azul, y barranquero.